南京医科大学工会委员会在学校党委和江苏省教育科技工会的领导下开展工作，下辖20个分工会，设有工会经费审查委员会、女教职工委员会。工会近年来积极履行职责，在教育引领、民主管理、服务创新、文化提升、自身建设等方面做了大量工作，努力为教职工送温暖、办实事，维护教职工合法权益，竭诚服务教职工群众，提升教职工使命感、责任感、获得感、归属感、信任感，建设文明、和谐、温暖、活力、规范的幸福之家，为服务学校发展大局和幸福校园建设做出了应有贡献。